На ПП «Кондинские озера» возлагаются следующие задачи:

а) охрана эталонных и уникальных природных комплексов и объектов:

- водной системы Кондинских озер, являющейся основообразующей экосистемой парка,

- ландшафтных экосистем, не тронутых интенсивным освоением,

- животных, ведущих кочевой образ жизни (дикий северный олень - таежный подвид),

- памятников истории и археологии;

б) организация научно-исследовательской и просветительской деятельности;

в) ведение экологического мониторинга;

г) создание условий для регулируемого туризма и зон отдыха.